معلومة

تصحيح قراءة عدد المسامير

تصحيح قراءة عدد المسامير


We are searching data for your request:

Forums and discussions:
Manuals and reference books:
Data from registers:
Wait the end of the search in all databases.
Upon completion, a link will appear to access the found materials.

لدي 4 عينات من RNA-seq (الأول هو التحكم والآخر 3 علاجات) و 5 مسامير. لقد استخدمت تركيزات مختلفة لـ 5 مسامير ولكن على عينات مختلفة ، استخدمت تركيزًا مشابهًا. على سبيل المثال ، استخدمت تركيزًا مشابهًا لـ spike1 في 4 عينات. وهذا هو الحال بالنسبة لبقية المسامير. أحاول تطبيع عدد القراءة للارتفاع. هل تعرفون يا رفاق كيف تفعل ذلك؟

هذا ما فعلته حتى الآن: لقد قمت بحساب المسامير في عينات مختلفة وحصلت على الحصة منها (المعالجات مقارنة بالضوابط لجميع المسامير). النسبة كما هو متوقع (بالنظر إلى تركيز المسامير). أحد الأشياء التي يمكنني القيام بها لتصحيح عدد مرات القراءة للارتفاعات هو الضرب في النسبة بين العينات. لكني لست متأكدًا مما إذا كانت هذه هي الطريقة الصحيحة.


الطريقة الأكثر شيوعًا والأبسط لتسوية المسامير هي إجمالي عدد التطبيع. إنه في الواقع ما تفعله هنا ، لذا ما تفعله هنا صحيح. TCM هي خوارزمية مفيدة لتطبيع عمق التسلسل ، بما في ذلك كميات الارتفاع الخاصة بك.

https://academic.oup.com/bib/article-lookup/doi/10.1093/bib/bbs046

لديه إشارة إلى تطبيع الطب الصيني التقليدي.

يتم قسمة عدد الجينات على العدد الإجمالي للقراءات المعينة (أو حجم المكتبة) المرتبطة بمسارها ومضروبة في متوسط ​​العدد الإجمالي عبر جميع عينات مجموعة البيانات.

لا تتحدث الصحيفة عن الضوابط المتصاعدة ، لكن الفكرة هي نفسها. سنستخدم أدوات التحكم في الارتفاع لتقدير الاختلاف في عمق التسلسل (بدلاً من مجموعة البيانات بأكملها).


شاهد الفيديو: اسهل طريقة قياسالقدمة ذات الورنية. مللى. Vernier Caliper. mm (شهر نوفمبر 2022).